2003年，根据农业部农市发 [2003]8 号《关于加强农产品质量安全检验检测体系建设的意见》和粤府办 [2002]98 号《关于切实加强农产品质量安全监检测体系建设》的有关精神 , 佛山市委市政府对此项工作十分重视 ,把市农产品质量安全监督检测中心的建设作为佛山市政府的一项民心工程来抓。市农产品质量安全监督检测中心从2003年建成之初到现在，在市委、市政府的重视和关怀下，在上级领导的大力支持下，在广大市民的关心下，正在正常、高效地运行。

2004年7月，佛山市农产品质量安全监督检测中心建成并顺利通过了中国实验室认可委员会的认可和广东省计量认证的“双认证”。四年多来，佛山市政府高度重视全市农产品质量安全体系建设，市级中心的检测仪器设备不断充实，配备有先进的精密检测仪器，包括液质联用仪、气质联用仪、双塔进样气相色谱仪、气相色谱仪、液相色谱仪、原子吸收光谱仪、原子荧光仪、荧光PCR仪、大气采样器、大容量农药残毒速测仪、紫外光栅分光光度计、酶标检测仪、凝胶成像分析系统、黄曲霉素速测仪等百余台(套)先进的检测仪器设备，检测技术不断提高，目前经“双认证”的农产品检测项目达202项，可开展农产品中农药、兽药、抗生素、激素、重金属、微生物、硝酸盐、亚硝酸盐等残留检测。涵盖了农产品质量安全检测、无公害生产基地检定、部分农业投入品的检测和重大动物疫病的监测等范围。